玉ねぎを栽培している地域は多数あります。日本の産地ランキングでは、1位北海道、2位佐賀県、3位兵庫県の順となっています。その中でも、北海道は日本全国の生産の60%以上を占めています。
北海道の中でも北東地域に所在する北見市が全国の生産の20%を占めています。冷涼な地域で育てられるため、玉ねぎ全体が引き締まり、辛味が少なくより甘い玉ねぎが育っています。大正時代に北見市には玉ねぎの栽培が伝わりましたが、当初は年間を通して栽培することが困難でした。栽培時期や品種改良により、今では年間を通して生産できます。
また、生産量が3位ではありますが、兵庫県の玉ねぎも有名です。兵庫県では、淡路島さんが有名です。温暖な気候を生かして栽培されており、柔らかくて甘味のあるものが出荷されています。辛味成分が通常のものよりも大幅に少ないことが特徴です。
地域により、特徴は異なりますが、甘味の強いものが一般的には好まれ流通量が多くなる傾向にあります。